Hyōton: (jap. 氷遁) - "w lodzie ukrycie" - jedynym znanym posiadaczem tej umiejętności jest Haku (jego matka także posiadała tą umiejętność, lecz skrzętnie ją ukrywała), którego klan - Shiro - z powodu swoich zdolności został wybity podczas wojny domowej. Ta zaawansowana więź krwi pozwala Haku na nieograniczoną kontrolę nad wodą i wiatrem. Dzięki temu może dokonać fuzji tych dwóch żywiołów dającą lód. Posiadacz Hyōton'u, może także dowolnie kształtować lód, wedle własnej woli, tworząc np: ostre lodowe igły lub olbrzymie lodowe lustra. Kekkei genkai Haku odróżnia go od innych shinobi manipulujących wodą lodem czy śniegiem tym, że aby Hyōton działał nie jest potrzebna woda śnieg czy lód. Warto wspomnieć, że Haku może wykonywać pieczęcie jedną ręką, gdy wszyscy inni potrzebują obu rąk - nie wiadomo czy to efekt ciężkiego treningu Haku czy też jedna z umiejętności jaką daje Hyōuton.





Mokuton: (jap. 木遁) - "w drzewie/drewnie ukrycie" - unikatowa zdolność Pierwszego Hokage, a teraz Yamato, polegająca na zamianie swej chakry w energie życiową. Niestety wraz z jego śmiercią ta umiejętność na długi czas poszła w zapomnienie, gdyż nikt nie odziedziczył po nim tej umiejętności. Mokuton pozwala użytkownikowi na nieograniczoną kontrolę nad ziemią i wodą, dzięki czemu może wytwarzać wszelaką roślinność i potem nią manipulować. Rozmiary i długości wytwarzanych roślin, są ograniczone jedynie do woli i ilości chakry posiadacza. Ponadto techniki Mokuton pozwalają na kształtowanie drewna według woli użytkownika (Yamato, na przykład potrafi wznieść wielką willę lub stworzyć klona z drewna), dzięki temu shinobi może tworzyć naprawdę wymyślne i oryginalne techniki, które jednak są w znacznym stopniu narażone na techniki powiązane z żywiołem ognia.



Shikotsumyaku: (jap.屍骨脈) - Kekkei genkai, którego posiadaczami byli członkowie nie istniejącego już klanu Kaguya. Wszyscy członkowie klanu posiadali bardzo twarde, wręcz niezniszczalne kości już od urodzenia. W kolejnych latach uczyli się kontrolować przepływ chakry przez swoje własne kości, dzięki czemu uzyskiwali zdolność manipulowania nimi. Sprawia to że złamanie którejkolwiek z tych kości (w organizmie członka tego klanu) było wręcz niewykonalne. Posiadacz Shikotsumyaku mógł bez problemów wyciągać swoje kości poza organizm, a rany które powstawały poprzez przebicie kośćmi skóry goiły się błyskawicznie. Posiadali także możliwość zrastania, wyciągania, kształtowania i odbudowywania swoich kości dzięki czemu ich ilość była nieograniczona. Po ich wcześniejszym utwardzeniu tak, że stawały się wtedy twardsze od stali i ostre niczym brzytwa, można było także tworzyć z nich broń i używać do obrony i bezpośredniego ataku oraz niezwykle twardą zbroję z kości, na swoim ciele. Najważniejsze techniki klanu Kaguya określane były jako tańce. Ze względu na swoje umiłowanie do prowadzenia walk, wszyscy członkowie klanu Kaguya zostali zgładzeni.





Sōma no Kō: (jap. 双魔の攻) - Kekkei genkai, którego posiadaczami są Sakon i Ukon, nazwa klanu z jakiego pochodzą jest nieznana. Ta więź krwi pozwala na połączenie swego ciała albo jej części z innym członkiem klanu na poziomie molekularnym. Tacy połączeni shinobi, uzyskują wspólną siłę, szybkość i wytrzymałość. Zwykle przez większość czasu, jeden z dwóch ninja, pozostaje uśpiony kiedy drugi pozostaje aktywny i budzi się dopiero na czas walki. Z ciała użytkownika w każdej chwili i z każdego miejsca, może wyrosnąć część ciała osoby z którą się połączyła. Wtedy użytkownik może zarówno bronić się, jak i atakować jednocześnie przeciwnika. Rozdzielenie obu ninja, jest możliwe ale wymaga sporej ilości chakry i siły obydwu shinobi. Jeśli w czasie rozdzielenia jeden z ninja zostanie ranny, może w miarę szybko wyleczyć się z ran jeśli znów połączy się że swym partnerem. Sōma no Kō pozwala także na połączenie swego ciała z ciałem przeciwnika nie należącego do klanu w celu osłabienia jego potencjału bojowego i w efekcie doprowadzenie do jego śmierci. Jeśli połączeni ninja zostaną zranieni, to obrażeniom ulegną narządy obydwu z nich, nie wiadomo jaki efekt dla braci ma utrata całej jednej kończyny.





Kekkei genkai Ranmaru: Pozbawione nazwy oczne kekkei genkai, którego jedynym znanym posiadaczem jest Ranmaru z wioski Kiri, to kekkei genkai pojawia się tylko w "fillerach" anime. Kiedy użytkownik korzysta z tej mocy, jego oczy jarzą się na czerwono. To kekkei genkai pozwala widzieć przez ściany i przedmioty dookoła swej głowy. Zasięg tej techniki nie jest znany, ale przypuszczalnie jest większy od Byakugana. Technika ta pozwala także dostrzec wewnętrzne systemy kontroli chakry i wykonać ich kopie w stworzonych przez siebie klonach, tak że nawet posiadacz Byakugana nie odróżni klona od oryginału, dopóki się do niego zbytnio nie zbliży.